Nova Andradina está passando por obras importantes de saneamento com ampliação da ETE (Estação de Tratamento de Esgoto), novas redes de coleta e ligações domiciliares de esgoto, entre outras melhorias complementares do sistema. São R$ 16,7 milhões em recursos provenientes em parte do Governo Federal (R$ 4,6 milhões do Programa de Aceleração do Crescimento (PAC 2) via Funasa, e o restante da Sanesul, oriundo do Avançar Cidades, programa lançado pelo Ministério das Cidades, por meio de convênios com a Caixa Econômica Federal.
Está incluso neste grande pacote de obras a ampliação da capacidade da Estação de Tratamento de Esgoto (40 litros/segundo); 1.404 metros do emissário; 77km de rede coletora de esgoto e 9 mil ligações domiciliares de esgoto. Também serão construídas três elevatórias; 4.541 metros de linha de recalque, e adequação em outras elevatórias. Esses investimentos vão elevar o índice de cobertura de esgoto do município até 47% com o fim das obras.
Em Nova Andradina, o serviço de abastecimento de água tratada também é realizado pela Sanesul. O município possui uma conta de investimentos na atual gestão do Governo do Estado (Concluído + Em execução + A executar) de cerca de R$ 40 milhões (R$ 35,5 milhões são recursos Sanesul) integralmente aplicados nos sistemas de água e esgoto da cidade.